Einflussfaktoren bei der Proteinprozessierung des Kälteschockproteins Y-box binding protein-1
Fragestellung
Gibt es Einflussfaktoren auf die „spontane Spaltung“ des Kälteschockproteins YB-1 und wie wirken sie sich auf die Fragmentbildung aus?
Förderung
SFB 854
Kurzzusammenfassung
Das Y-box binding protein-1 (YB-1) ist ein multifunktionales Kälteschockprotein, welches als Transkriptionsfaktor dient. Es reguliert Transkription, Translation und das Spleißen und reagiert auf zellulären Stress durch Bindung von Einzelstrang-DNA. Für YB-1 sind eine Reihe von posttranslationalen Modifikationen (z.B. Phosphorylierung, Acetylierung) und eine Proteasom-Spaltungsstelle bekannt. Vorversuche weisen bei rekombinanten YB-1 auf eine spontane Selbst-Spaltung hin, d.h. die Proteinfraktionen sind auch in Anwesenheit von Protease- und Proteasomhemmern metastabil. In der Masterarbeit werden nach Herstellung von rekombinanten Wildtyp-YB-1-Proteinen das Selbst-Spaltungsverhalten in Gegenwart von verschiedenen Regulatoren (ATP/ AMP, pH-Wert, ssDNA, dsDNA, RNA) untersucht.
Mögliche Einflussfaktoren auf die Selbstspaltung
Ansprechpartnerin
Anne Heyer
Literatur
Gaudreault et al. (2004): YB-1 promotes strand separation in vitro of duplex DNA containing either mispaired bases or cisplatin modifcations, exhibits endonucleolytic activities and binds several DNA repair proteins. Nucleic Acids Research 32: 316 – 327.
Belfort et al. (2017): Mobile self-splicing introns and inteins as environmental sensors. Curr Opin Microbiol. 38: 51–58.
Lyabin et al. (2014): YB-1 protein: functions and regulation. Wiley Interdiscip Rev RNA. 5: 95 – 110.