Einflussfaktoren bei der Proteinprozessierung des Kälteschockproteins Y-box binding protein-1
Fragestellung
Gibt es Einflussfaktoren auf die „spontane Spaltung“ des Kälteschockproteins YB-1 und wie wirken sie sich auf die Fragmentbildung aus?
Förderung
SFB 854
Kurzzusammenfassung
Das Y-box binding protein-1 (YB-1) gehört zur Familie der Kälteschockprotein und hat mehrere Funktionen im Zellstoffwechsel. Es bindet unter anderem an DNA und reagiert so auf zellulären Stress, welcher z.B. durch Strahlung oder Chemotherapeutika ausgelöst werden kann.
Vorversuche weisen darauf hin, dass YB-1 sich spontan selbst spaltet. Diese Selbst-Spaltung ist besonders interessant, weil im Serum von Tumorpatienten Spaltprodukte von YB-1 gefunden wurden. In der Masterarbeit wird das Selbst-Spaltungsverhalten von YB-1 in Gegenwart von verschiedenen Einflussfaktoren wie ATP/ AMP, pH-Wert, DNA und RNA untersucht.
Mögliche Einflussfaktoren auf die Selbstspaltung
Ansprechpartnerin
Anne Heyer
Literatur
Gaudreault et al. (2004): YB-1 promotes strand separation in vitro of duplex DNA containing either mispaired bases or cisplatin modifcations, exhibits endonucleolytic activities and binds several DNA repair proteins. Nucleic Acids Research 32: 316 – 327.
Belfort et al. (2017): Mobile self-splicing introns and inteins as environmental sensors. Curr Opin Microbiol. 38: 51–58.
Lyabin et al. (2014): YB-1 protein: functions and regulation. Wiley Interdiscip Rev RNA. 5: 95 – 110.